2018年3月23日下午，中国农业科学院农业基因组研究所所长黄三文带队访问了中国农业科学院棉花研究所，在与棉花所所长李付广、党委书记吕春生等领导充分交换意见的基础上，双方签署了全面合作协议。

 这是基因组所与兄弟单位签署的首个全面合作协议，也是推动“世界一流”科研院所建设、加快院所协同创新，培育“引领性、革命性、颠覆性”科技成果的重大举措。双方一致同意共建“棉花生物学国家重点实验室深圳基因组研究中心”，在人才团队的互聘融合、学生的联合培养和科技项目的联合申报上实现强强联合。

 黄三文介绍了基因组所关于“基础所、平台所、前沿所、人才所、深圳所”的具体举措，以及深圳“开放、包容”发展理念和政策。目前基因组所与棉花所合作完成的亚洲棉基因组学文章已经被《自然·遗传（Nature Genetics）》杂志接收，充分体现了基因组所牵头的国家农业基因组科技创新联盟在基因组研究上的重要进展。进一步强调基因组联盟要打破院所机构限制，克服孤岛现象，促进成员单位的有机互动与强强联合，推进协同攻关，着力破解农业基因组学关键性、瓶颈性技术难题；同时要积极争取地方政府的支持，为科研开展提供保障。

 李付广对基因组所的重大科研成果产出给予了充分肯定，并指出加强兄弟院所协同创新是推动重大成果培育、加强人才培养、实现平台共享、提升研究生教育的重要途径。双方在棉花基因组学领域已经具备良好的合作基础，进一步发挥基因组所区位、政策优势及棉花所应用优势，将实现双方互利共赢和跨越发展。