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创新团队

  

农业基因组学技术研发与应用创新团队


首席科学家阮珏


团队构成阮珏课题组、常玉晓课题组、崔鹏课题组、徐炜课题组、张兴坦课题组、邵浩靖课题组纪宏超课题组、陈琦翩课题组、樊伟课题组潘玮华课题组


研究方向: 研发组学算法和测序方法,致力于解决基因组学及其他组学研究中核心方法学问题。


研究成绩:团队开发了三代测序数据组装的主流算法软件 SMARTdenovo 和 WTDBG ;开发出最佳平衡准确度的体细胞结构变异检测算法 NovoBreak ;在低频突变检测上,连续开发了 Droplet-CirSeq、O2N-seq、 微量DNA扩增等技术,将二代测序错误率从10-2-10-3水平降低至10-5-10?8水平的同时,数据有效率提高10-30倍;建立了 ribominusRNA-seq (rmRNA-seq) 实验和分析方法,并应用到植物基因可变剪接和植物抗逆的研究;开发了 NSF-Mate Pair Library 技术加速大片段DNA文库构建。团队独立研发的组学技术以及与相关科研院所高??沟淖檠Ъ际鹾献飨钅砍晒群蠓⒈碓?Nature、Nature Genetics、Nature Methods、Nature Communications 等国际期刊,在农业基因组学技术研究领域产生重要的影响。团队先后承担了国家重点研发计划项目、国家优秀青年科学基金项目、国家自然科学基金面上及青年基金项目等国家级科研项目。


更新于2025年6月


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