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张兴坦

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张兴坦,研究员、博士生导师。2009年于哈尔滨工业大学本科毕业,2015年于重庆大学获得植物学博士学位。张兴坦研究员长期致力于植物功能基因组学研究,研究领域包括复杂基因组的组装和分型、生物信息分析技术的开发、基于组学大数据挖掘重要功能基因等。研究成果以第一或通讯作者(含共同)在Cell, Nature, Nature Genetics, Nature Plants, Nature Communications等高水平期刊发表。

工作经历

2020.10-至今           中国农业科学院农业基因组所,研究员

2015.07-2020.10     福建农林大学,讲师/副教授

教育经历

2009.09 - 2015.06     重庆大学 植物学,  理学博士

2013.10 - 2014.10     J. Craig Venter Institute ,  访问博士生

2005.09 - 2009.06     哈尔滨工业大学 生物工程 ,  工学学士

研究方向

1. 复杂多倍体/高杂合二倍体基因组组装和分型方法的开发

2. 基于NGS或单分子测序技术开发生物信息分析算法和工具

3. 基于组学大数据挖掘植物重要功能基因并解析其生物学机制

研究进展

开发ALLHiC算法解决同源多倍体染色体分型难题,并破译第一个同源多倍体甘蔗基因组 (Zhang, et., al. Nature Genetics, 2018; Zhang, et., al. Nature Plants, 2019);破译多个榕树基因组,组装和分型X和Y性染色体,揭示榕属性别决定因子、气生根形成机制、榕蜂协同演化、杂交渐渗对其物种快速形成的机制等科学问题 (Zhang, et., al. Cell, 2020, Wang, et., al. Nature Communications, 2021).

       主要讲授课程:基因组学。


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